O tratamento da endometriose pode ser clínico, com medicações como anti-inflamatórios não hormonais, pílulas contraceptivas e análogos do GnRH, ou cirúrgico, neste caso quase sempre por intermédio da laparoscopia. Considerada o método ideal para eliminar os focos da doença, a cirurgia laparoscópica também faz o diagnóstico de certeza da endometriose.